一九九三年十月正式成立，同時展開全臺灣的造血幹細胞捐贈驗血活動。中心下轄免疫基因實驗室、臍帶血庫、臨床醫學暨研究組、捐贈活動暨關懷組、資料庫暨行政組等五個部門，以正式的非營利組織形式推動造血幹細胞及臍帶血捐贈。

慈濟骨髓幹細胞中心擁有全臺灣唯一也是非公立的造血幹細胞資料庫，連續四年榮獲SNQ品質標章及第二十一屆生技醫療品質奬，提供全臺37家、海外1,149家醫院尋求病患配對。

慈濟骨髓幹細胞中心成立三十年，至2023年7月31日止募集467,733筆資料登記、尋求配對患者68,444位、移植案例6,494例。慈濟骨髓幹細胞中心的免疫基因（HLA）實驗室每月檢驗超過一千人次的HLA，其精準的檢驗策略及執行能力大大提升移植成功率，不僅讓血液疾病患者重現生機，也可望為巴金森氏症、惡性腫瘤、腦中風和肝病患者，帶來治療新契機。

作者群：
吳玉對、劉蓁蓁、黃淑惠、黃秋惠、柯玲蘭、何予懷、陳誼謙、藍明姮、陳秀貴、李佩璇、顏福江、吳珍香、曾修宜、白佳立、侯宜君、梁寶蓮、丁瑟琴、呂巧美、劉桂芬、鄭智瀚、陳淑美、楊絮惠、黃懷萱、李委煌